La final más célebre entre estos equipos fue la que disputaron en el segundo semestre de 2004. En aquella oportunidad, Junior ganó 3-0 el partido de ida, en Barranquilla, con goles de Leonardo Rojano, Hayder Palacio y Roberto Peñaloza.
En la vuelta, en Medellín, Nacional se impuso 5-2 con goles de Aquivaldo Mosquera (2), Édixon Perea, Carlos Díaz y Héctor Hurtado. Por Junior marcaron Martín Arzuaga y Walter Ribonetto. En la definición desde el punto penal, los rojiblancos, dirigidos por Miguel Ángel ‘Zurdo’ López, ganaron 5-4 y se coronaron campeones.
Por Junior acertaron desde el punto blanco Omar Pérez, Émerson Acuña, Francisco Alvear, Walter Ribonetto y Martín Arzuaga. Por Nacional anotaron Humberto Mendoza, Aquivaldo Mosquera, Jorge Rojas y Oswaldo Mackenzie. Luis Fernández atajó el cobro de Juan Carlos Ramírez.
La segunda final la jugaron en el primer semestre de 2014. En Barranquilla, en el partido de ida, Junior ganó 1-0 con gol de Édinson Toloza y, en el de vuelta, en Medellín, goles de Alexis Henríquez y John Valoy, a escasos segundos del pitazo final, le dieron al cuadro verde el triunfo y la posibilidad de ir a la tanda de penales en donde se impuso 4-2 y se quedó con el título.
La gran figura fue el portero argentino Franco Armani, quien atajó los cobros de Sebastián Viera y Johnny Vásquez. Por Junior marcaron‘Carachito’ Domínguez y Luis Narváez.
Por Nacional acertaron Juan David Valencia, Edwin Cardona, Daniel Bocanegra y Alejandro Bernal.
La última final la jugaron en el segundo semestre de 2015. En el primer duelo, en Barranquilla, Junior ganó 2-1 con goles de Roberto Ovelar y Édinson Toloza. Yimmi Chará descontó para Nacional.
En la vuelta, en Medellín, el equipo ganó 1-0 con gol al minuto de juego de Marlos Moreno, lo que obligó a la definición por tiros desde el punto penal donde el local se impuso 3-2 y se alzó con el título.
Por Nacional marcaron Yimmi Chará, Alejandro Guerra y Sebastián Pérez. Viera atajó el cobro de Daniel Bocanegra.
Por Junior convirtieron Luis Narváez y Roberto Ovelar. Guillermo Celis botó el suyo y Armani le atajó a Félix Noguera y Gustavo Cuéllar.
Este año, el único enfrentamiento entre Junior y Nacional se registró el 10 de marzo en el Romelio Martínez, juego que los verdolagas ganaron 4-0 con goles de Juan Manuel Rengifo, Alfredo Morelos, Dairon Asprilla y Marlos Moreno.
